He estado utilizando versiones beta de .NET Framework 3.5, coexistiendo con .NET Framework 2.0, en mi laptop personal durante meses, y mis aplicaciones han seguido funcionando sin problemas. El mismo MSGuayaquil.com estará coexistiendo con .NET Framework 3.5 para la próxima semana y no esperamos tener problema alguno.
Saludos,
Julio.